XmnI
产品编号 | 产品名称 | 包装规格 | 价格 |
NBS8230 | XmnI | 500 U | 300 |
产品简介:
XmnI属于Type IIP型限制酶,来源于木薯萎蔫病黄单胞菌(Xanthomonas manihotis),经大肠杆菌重组表达后纯化获得。XmnI识别并切割GAANN/NNTTC序列,切割后形成平末端,在Cut Buffer C中表现最佳的性能与星号活性控制。XmnI可兼容通用 CutOne® Buffer,方便与其他内切酶联用实现快速双酶切,但应避免长时间酶切,以防止出现星号活性。
识别位点:
GAANNNNTTC
5'...G A A N N↓N N T T C...3'
3'...C T T N N↑N N A A G ...5'
同裂酶:PdmI, MroXI
注:同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
产品组成:
组分 | 规格 |
XmnI (10 U/μl) | 50 μl |
10× Cut Buffer C | 1 ml |
保存条件:
-20℃保存,2年有效。
建议反应条件:
1× Cut Buffer C;
37℃温育;
参照“DNA 酶切流程”配制反应体系。
失活条件:
80℃温育20 min。
甲基化敏感性:
对于被 CpG 甲基化的 DNA,剪切可能受阻。
对于被EcoBI甲基化的DNA,剪切可能受阻。
活性定义:
1活性单位 (U) 是指在激活剂存在下,50 μl反应体系中,37℃ 1 h 内完全酶切1 µg λDNA 所需的酶量。
功能活性检测:
37℃下,10 U XmnI能够在15 min内完全消化1 μg λDNA。
超长时间温育检测:
37℃下,将10 U XmnI与1 μg λDNA共同温育3 h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解。延时酶切可能出现星号活性。
酶切-连接-再酶切检测:
37℃下,使用10 U XmnI消化底物,回收酶切产物。在22℃下使用适量T4 DNA Ligase (Fast)可以将酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开连接产物。
使用方法:
1. DNA酶切流程
① 在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:
ddH2O | up to 50μl |
10× Cut Buffer C | 5μl |
底物DNAa | 1μg |
XmnI (10 U/μl) | 1μl |
Total | 50μl |
a. DNA 底物中应不含苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、洗涤剂或高浓度盐,否则将会影响XmnI酶活性;
② 轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;
③ 37℃温育1~3 h;
④ 80℃温育20 min即可使酶失活,停止反应,或者通过吸附柱或苯酚/氯仿纯化终止反应。
不同DNA中的酶切位点数量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
24 | 3 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 5 |
甲基化修饰影响
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
无影响 | 无影响 | 剪切受影响 | 无影响 | 剪切受阻 |
在不同反应缓冲液中的活性
CutOne® Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB rCutSmart™ Buffer | Takara QuickCut™ Buffer | ||
活性 | 100% | 100% | 100% | 100% | |
注:活性数据来自限制酶标准反应体系下的检测。
注意事项:
1. XmnI使用CutOne® Buffer进行酶切时,酶切反应时间建议不超过1 h。
2. 反应体系中加入的酶体积不应超过总体积的10%,避免酶中过多的甘油引起星号活性;
3. 限制性内切酶存储缓冲液中的添加剂(例如甘油、盐)与底物溶液中的污染物(例如盐、EDTA或乙醇等)相同,反应体积越小,酶切反应抑制效应越强;
4. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
相关常规限制性内切酶产品:
产品编号 | 产品名称 | 包装规格 |
100 U | ||
500 U | ||
50 U | ||
250 U | ||
300 U | ||
200 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
200 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
1000 U | ||
500 U |