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识别位点： GCGGCCGC 5'...G C ↓ G G C C G C...3' 3'...C G C C G G ↑ C G...5' 同裂酶：CciNI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。 -
识别位点： GCTAGC 5'...G ↓ C T A G C...3' 3'...C G A T C ↑ G...5' 同裂酶：AsuNHI 异裂酶：BmtI, BspOI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CATATG 5'...C A ↓ T A T G...3' 3'...G T A T A ↑ C...5' 同裂酶：FauNDI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CCATGG 5'...C ↓ C A T G G...3' 3'...G G T A C ↑ C...5' 同裂酶：Bsp19I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CAATTG 5'...C ↓ A A T T G...3' 3'...G T T A A ↑ C...5' 同裂酶：MfeI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： CCGG 5'...C ↓ C G G...3' 3'...G G C ↑ C...5' 同裂酶：HpaII, HapII, BsiSI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： TTAA 5'...T ↓ T A A...3' 3'...A A T ↑ T...5' 同裂酶：SaqAI, Tru9I, Tru1I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： TGGCCA 5'...T G G ↓ C C A...3' 3'...A C C ↑ G G T...5' 同裂酶：BalI, MlsI, Mox20I, Msp20I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： CCTC(7/6) 5'...C C T C N₇ ↓...3' 3'...G G A G N₆ ↑...5'
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识别位点： ACGCGT 5'...A ↓ C G C G T...3' 3'...T G C G C ↑ A...5'
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