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识别位点： GTAC 5'...G T ↓ A C...3' 3'...C A ↑ T G...5' 同裂酶：AfaI 异裂酶：Csp6I, CviQI, RsaNI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。 -
识别位点： CAGCTG 5'...C A G ↓ C T G...3' 3'...G T C ↑ G A C...5'
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识别位点： CGATCG 5'...C G A T ↓ C G...3' 3'...G C ↑ T A G C...5' 同裂酶：Ple19I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CTGCAG 5'...C T G C A ↓ G...3' 3'...G ↑ A C G T C...5' 同裂酶：BspMAI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CCWGG 5'...↓C C W G G ...3' 3'... G G W C C↑...5' 同裂酶：EcoRII, Psp6I, AjnI 异裂酶：BciT130I, BseBI, Bst2UI, BstNI, MvaI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CACGTG 5'...CAC ↓ GTG...3' 3'...GTG ↑ CAC ..5' 同裂酶：AcvI, Eco72I, PspCI, BbrPI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： GTTTAAAC 5'...G T T T ↓ A A A C...3' 3'...C A A A ↑ T T T G...5' 同裂酶：MssI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： TTAATTAA 5'...T T A A T ↓ T A A...3' 3'...A A T ↑ T A A T T...5'
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识别位点： ATGCAT 5'...A T G C A ↓ T...3' 3'...T ↑ A C G T A...5' 同裂酶：EcoT22I, Mph1103I, Zsp2I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： TCGCGA 5'...T C G ↓ C G A...3' 3'...A G C ↑ G C T...5' 同裂酶：Bsp68I，BtuMI，RruI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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