<NBS8240> I-SceI

栏目:NoninBio
分享到:
I-SceI是一种来源于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的II型内含子编码的核酸内切酶(Intron-encoded endonuclease),特异性识别并切割18 bp非回文序列(5'-TAGGGATAACAGGGTAAT-3'),形成4 bp的3'突出黏性末端。由于识别序列极长,其在基因组中自然出现的概率极低(约每7×10^10个随机碱基出现一次),这使得I-SceI成为精准基因组操作的理想工具。

识别位点:
TAGGGATAACAGGGTAAT
5'...T A G G G A T A A ↓ C A G G G T A A T...3'
3'...A T C C C ↑ T A T T G T C C C A T T A...5'

 

I-SceI

 

产品编号

产品名称

包装规格

价格

NBS8240

I-SceI

250U(5U/μl)

300

 

产品简介:

  I-SceI是一种来源于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的II型内含子编码的核酸内切酶(Intron-encoded endonuclease),特异性识别并切割18 bp非回文序列(5'-TAGGGATAACAGGGTAAT-3'),形成4 bp3'突出黏性末端。由于识别序列极长,其在基因组中自然出现的概率极低(约每7×10^10个随机碱基出现一次),这使得I-SceI成为精准基因组操作的理想工具。

 

识别位点:

TAGGGATAACAGGGTAAT
5'...T A G G G A T A A ↓ C A G G G T A A T...3'
3'...A T C C C ↑ T A T T G T C C C A T T A...5'

 

产品组成:

组分

规格

I-SceI (5 U/μl)

50 μl

pUC-I-SceI (100 ng/μl)

20 μl

10× FastCut Buffer

1 ml

10× FastCut Color Buffer

1 ml

 

保存条件

-20℃保存,2年有效。

 

建议反应条件:

1× FastCut缓冲液;

37℃温育;

参照“DNA 快速酶切流程配制反应体系。

 

失活条件:

80℃温育20 min

 

活性定义:

1 活性单位(U)是指在37℃条件下反应1 h酶切1 μg pUC-I SceI 所需的酶量。

 

功能活性检测:

37℃下,在20 μl通用FastCut反应体系中,1 μl I-SceI能够 在15 min内完全消化1 μg pUC-I-SceI

 

超长时间温育检测:

37℃下,在20 μl通用FastCut反应体系中,将1 μl I-SceI 1 μg pUC-I-SceI 共同温育3 h,未检测到其他核酸酶污染引起的底 物非特异性降解。

 

酶切-连接-再酶切检测:

37℃下,使用10倍酶量的I-SceI消化DNA底物,回收酶切产物, 在22℃下使用T4 DNA Ligase (Fast)可以将超过95%的酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开约95%以上的连接产物。

 

使用方法:

1. DNA酶切流程

在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:

在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:


质粒DNA

PCR产物

基因组DNA

ddH2O

15μl

16μl

30μl

10× FastCut Buffer 10× FastCut Color Buffer

2μl

3μla

5μl

底物DNA

2μl (up to 1μg)

10μl (~0.2μg)

10μl (5μg)

FastCut AatII

1μl

1μl

5μl

Total

20μl

30μl

50μl

a.本体系适用于经过纯化的PCR产物酶切。未纯化的PCR产物具备一定的离子强度,10× FastCut Buffer 加入量可适当减少至2 μl。但由于DNA聚合酶同时具有外切酶活性,会影响酶切产物,因此如下一步需进行克隆等操作,建议酶切前对PCR产物进行纯化。

轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;

③ 37℃温育15 min(质粒),或15~30 minPCR产物),或30~60 min(基因组DNA); ④ 80℃温育20 min即可使酶失活,停止反应(可选);

如果使用FastCut Color Buffer进行酶切反应,得到的产物可以直接进行上样电泳。

 

2. 适用于质粒的扩大反应体系

DNA

1μg

2μg

3μg

4μg

5μg

I-SceI (5 U/μl)

1μl

2μl

3μl

4μl

5μl

10× FastCut Buffer

10×FastCut Color Buffer

2μl

2μl

3μl

4μl

5μl

Total

20μl

20 μl

30μl

40 μl

50 μl

注:如果总反应体系大于20 μl,应适当增加温育时间,尽量使用水浴、金属浴或沙浴。

 

不同DNA中的酶切位点数量

λDNA

ΦX174

pBR322

pUC57

pUC18/19

SV40

M13mp18/19

Adeno2

0

0

0

0

0

0

0

0

 

甲基化修饰影响

Dam

Dcm

CpG

EcoKI

EcoBI

无影响

无影响

无影响

无影响

无影响

 

注意事项:

1.      归位内切酶不具有限制性内切酶那样严格定义的识别序列。因此,单个碱基的改变并不影响其识别功能,但是会不同程度地降低酶切效率。识别序列中必需碱基的准确区域还不确定。列出的识别序列是已知可识别并酶切的位点。

2.      随酶提供对照质粒DNA,浓度为100 ng/μlI-SceI酶切产生 2711 bp 的片段。pUC-I-SceI为氨苄抗性,可自行转化后大量提取用于其他实验。

3.      为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。