I-SceI
产品编号 | 产品名称 | 包装规格 | 价格 |
NBS8240 | I-SceI | 250U(5U/μl) | 300 |
产品简介:
I-SceI是一种来源于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的II型内含子编码的核酸内切酶(Intron-encoded endonuclease),特异性识别并切割18 bp非回文序列(5'-TAGGGATAACAGGGTAAT-3'),形成4 bp的3'突出黏性末端。由于识别序列极长,其在基因组中自然出现的概率极低(约每7×10^10个随机碱基出现一次),这使得I-SceI成为精准基因组操作的理想工具。
识别位点:
TAGGGATAACAGGGTAAT
5'...T A G G G A T A A ↓ C A G G G T A A T...3'
3'...A T C C C ↑ T A T T G T C C C A T T A...5'
产品组成:
组分 | 规格 |
I-SceI (5 U/μl) | 50 μl |
pUC-I-SceI (100 ng/μl) | 20 μl |
10× FastCut Buffer | 1 ml |
10× FastCut Color Buffer | 1 ml |
保存条件:
-20℃保存,2年有效。
建议反应条件:
1× FastCut缓冲液;
37℃温育;
参照“DNA 快速酶切流程”配制反应体系。
失活条件:
80℃温育20 min。
活性定义:
1 活性单位(U)是指在37℃条件下反应1 h酶切1 μg pUC-I SceI 所需的酶量。
功能活性检测:
37℃下,在20 μl通用FastCut反应体系中,1 μl I-SceI能够 在15 min内完全消化1 μg pUC-I-SceI。
超长时间温育检测:
37℃下,在20 μl通用FastCut反应体系中,将1 μl I-SceI与 1 μg pUC-I-SceI 共同温育3 h,未检测到其他核酸酶污染引起的底 物非特异性降解。
酶切-连接-再酶切检测:
37℃下,使用10倍酶量的I-SceI消化DNA底物,回收酶切产物, 在22℃下使用T4 DNA Ligase (Fast)可以将超过95%的酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开约95%以上的连接产物。
使用方法:
1. DNA酶切流程
① 在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:
① 在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:
质粒DNA | PCR产物 | 基因组DNA | |
ddH2O | 15μl | 16μl | 30μl |
10× FastCut Buffer 或 10× FastCut Color Buffer | 2μl | 3μla | 5μl |
底物DNA | 2μl (up to 1μg) | 10μl (~0.2μg) | 10μl (5μg) |
FastCut AatII | 1μl | 1μl | 5μl |
Total | 20μl | 30μl | 50μl |
a.本体系适用于经过纯化的PCR产物酶切。未纯化的PCR产物具备一定的离子强度,10× FastCut Buffer 加入量可适当减少至2 μl。但由于DNA聚合酶同时具有外切酶活性,会影响酶切产物,因此如下一步需进行克隆等操作,建议酶切前对PCR产物进行纯化。
② 轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;
③ 37℃温育15 min(质粒),或15~30 min(PCR产物),或30~60 min(基因组DNA); ④ 80℃温育20 min即可使酶失活,停止反应(可选);
⑤ 如果使用FastCut Color Buffer进行酶切反应,得到的产物可以直接进行上样电泳。
2. 适用于质粒的扩大反应体系
DNA | 1μg | 2μg | 3μg | 4μg | 5μg |
I-SceI (5 U/μl) | 1μl | 2μl | 3μl | 4μl | 5μl |
10× FastCut Buffer 或10×FastCut Color Buffer | 2μl | 2μl | 3μl | 4μl | 5μl |
Total | 20μl | 20 μl | 30μl | 40 μl | 50 μl |
注:如果总反应体系大于20 μl,应适当增加温育时间,尽量使用水浴、金属浴或沙浴。
不同DNA中的酶切位点数量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
甲基化修饰影响
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
无影响 | 无影响 | 无影响 | 无影响 | 无影响 |
注意事项:
1. 归位内切酶不具有限制性内切酶那样严格定义的识别序列。因此,单个碱基的改变并不影响其识别功能,但是会不同程度地降低酶切效率。识别序列中必需碱基的准确区域还不确定。列出的识别序列是已知可识别并酶切的位点。
2. 随酶提供对照质粒DNA,浓度为100 ng/μl。I-SceI酶切产生 2711 bp 的片段。pUC-I-SceI为氨苄抗性,可自行转化后大量提取用于其他实验。
3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。