<NBS8042> EMSA/Gel-Shift化学发光法EMSA试剂盒

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本试剂盒基于电泳迁移率变动实验(EMSA/Gel-Shift),结合化学发光检测技术,用于快速、高灵敏度地检测蛋白质与核酸(DNA/RNA)的特异性相互作用,如转录因子、核酸结合蛋白等的结 合活性分析。试剂盒包含EMSA检测所需要的结合缓冲液,适用于基 础研究、药物筛选及分子机制研究。

 

EMSA/Gel-Shift化学发光法EMSA试剂盒

 

产品编号

产品名称

包装规格

价格

NBS8042

EMSA/Gel-Shift化学发光法EMSA试剂盒

100T

1875

 

产品简介:

本试剂盒基于电泳迁移率变动实验(EMSA/Gel-Shift),结合化学发光检测技术,用于快速、高灵敏度地检测蛋白质与核酸(DNA/RNA)的特异性相互作用,如转录因子、核酸结合蛋白等的结 合活性分析。试剂盒包含EMSA检测所需要的结合缓冲液,适用于基 础研究、药物筛选及分子机制研究。

 

保存条件

1-4组分-20℃保存,其他组分4ºC保存,1年有效。

如果长期不用,整个试剂盒可-20℃保存,-20℃可以保存更长时间。

 

产品组成:

组分

名称

规格

NBS8042-1

EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X

200ul

NBS8042-2

EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(无色,10X

200ul

NBS8042-3

EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(蓝色,10X

200ul

NBS8042-4

Streptavidin-HRP偶联物

100ul

NBS8042-5

洗涤液(5X

250ml

NBS8042-6

检测平衡液

250ml

NBS8042-7

ECL发光液A

50ml

NBS8042-8

ECL发光液B

50ml

NBS8042-9

无蛋白封闭液

380ml


自备试剂:

1. 探针 2. 提取用蛋白裂解液 3. 蛋白酶抑制剂 4. 带正电荷的尼龙膜或NC 5.  EMSA电泳相关试剂

 

操作步骤(供参考):

1. 样品制备

1)蛋白提取

a. 细胞样本: 收集1x107细胞,加入1ml 1xPBS洗涤一次,1000rpm离心5min去除上清,收集细胞;加入预冷裂解液1ml,同时按比例添加蛋白酶抑制剂,重悬细胞,剧烈涡旋10秒充分混匀,置于冰上30分钟,可每10 分钟充分吹打一次;4℃12000-16000g离心15分钟,将裂解产物(上清)转移到一个新的预冷管中,丢弃沉淀。

b. 动物组织: 将0.1g的组织切成非常细小的碎片,在冰浴条件下充分匀浆,用 100um的细胞筛等收集细胞悬液,可加1xPBS冲洗; 4℃1500g离心5min,弃上清收集细胞沉淀;沉淀中添加预冷的裂 解液200ul(需添加蛋白酶抑制剂)可额外添加10ul DTT,重悬细胞 后,剧烈涡旋10秒充分混匀,置于冰上30分钟,可每10分钟充分吹打一次; 4℃12000-16000g离心15分钟,将裂解产物(上清)转移到一个新的预冷管中,丢弃沉淀。 c. 植物组织和不易匀浆的动物组织: 去植物样本约0.2g,液氮研磨;加入500-1000ul预冷的裂解液(添 加蛋白酶抑制剂)进行裂解,为了提高裂解效率,可加入200ul玻璃粉(可选)按照600-800g离心力充分震荡30min,裂解完成后12000 rpm,离心30min,吸取上清置于新的离心管中,弃去沉淀。

d. 原核/真核表达蛋白: 诱导蛋白表达并鉴定表达形式,要求表达的蛋白为上清表达;纯化诱导 表达的蛋白;

e. 考马斯亮蓝或BCA测定蛋白样本浓度;

f. 样本分装为约40ul/管,保证每管含有5-25ug蛋白,液氮速冻后-80℃保存。

注意:避免反复冻融蛋白,分装保存于-80°C

 (2) 探针标记

使用生物素或荧光标记的DNA/RNA探针。

注意:探针需退火形成双链,避免核酸酶污染。

 

2. 结合反应

(1) 反应体系配制

根据以下表格配置不同组别的EMSA反应:

组分

实验组

阴性对照

野生型冷

探针对照

突变型冷

探针对照

Super -shift

终浓度

结合缓冲液(5X

2ul

2ul

2ul

2ul

2ul

1x

蛋白提取物或纯化后的转录因子

1-5ul

-

1-5ul

1-5ul

1-5ul

5-25ug

生物素标记探针

1ul

1ul

1ul

1ul

1ul

20fmol

竞争性探针

(野生)

-

-

-

50-200x

-

1-4pmol

竞争性探针

(突变)

-

-

50-200x

-

-

1-4pmol

目的蛋白抗体

-

-

-

-

0.5-1ul

0.5-1ug

ddH2O

Up to10ul


(2) 反应条件

按照以上顺序添加各试剂,加入未标记的探针或者抗体后混匀,并在PCR仪上37℃反应20min,让冷探针和抗体优先反应;加入标记好的探针混匀,在PCR仪上37℃反应20min

注:a. 避免剧烈震荡,防止复合物解离。

b. 如需做super-shift反应需自备抗体

c. 若蛋白为原核表达,经纯化后每个反应体系终含量为:25ng-75ng

d. 竞争性探针野生型和突变型的使用量均为生物素标记探针的50-200

 

3. DNA-EMSA非变性凝胶电泳配置

(1) 按照以下比例配置5%非变性PAGE胶,总体积10ml(可按比例扩大)

组分

体积

5XTBE缓冲液

1ml

ddH2O

6.5ml

40% Acr/Bis39:1

1.25ml

20% 甘油

1.25ml

10% APS

75ul

TEMED

5ul

依照上述次序依次加入各溶液,添加TEMED前需混匀,添加TEMED 后需要立即混匀并灌胶。灌胶时避免气泡并添加梳齿。

注:如发现制胶时很容易出现气泡,怎可对制胶玻璃板进行硅烷化处理。

(2) 上样与电泳每孔加入1μL 10X上样缓冲液(无色)混合样品后进行上样。

注:有些样品会受溴酚蓝影响,建议尽量使用无色的上样缓冲液上样时在多余的上样孔中加入10ul稀释后的1x上样缓冲液(蓝色)用于观察电泳进行的情况。

电泳条件:

电压:100V(恒压),建议按照10V/cm进行电泳

缓冲液:0.5XTBE缓冲液

时间:电泳至溴酚蓝迁移至距离胶底部1/4处。

注:低温电泳(4°C)可减少复合物解离,建议在电泳过程中观察电泳温度,确保温度不超过30℃,如果温度升高需要适当降低电泳电压;

 

4. 转膜与检测

(1) 转膜(尼龙膜/硝酸纤维素膜)

a. 取一张和EMSA胶大小相近的尼龙膜或NC膜,剪刀剪角做好标记,用0.5XTBE buffer浸泡10min以上;

注:尼龙膜或者NC膜请勿用手接触,全程用镊子夹取,且不能接触样品位置

b. 2张转印用滤纸,用0.5XTBE buffer浸泡,滤纸大小与上面转印膜的大小相近或者略大

c. 将浸泡过的膜置于浸湿的滤纸上,小心的取出EMSA胶放置于膜上;

d. 建议用湿转的方式进行转膜,转膜条件:100mA恒流(或约 390mA),4°C转膜约60min(缓冲液:0.5XTBE)。

e. 转膜结束后,用镊子小心取出膜,样品面向上,放置于干燥的滤纸上,轻轻吹掉表面比较明显的液体。立即进入交联(步骤(2))步骤。

注: a. 转膜时间建议在30-60min,如胶比较厚则应当适当延长转膜时间; b. 结合膜的表面一定不能干燥! c. 采用半干转膜仪建议按照390mA30min

(2) 交联

a. 利用紫外交联时建议交联条件为:120mJ/cm²,选择紫外波长254nm45-60s

如无紫外交联仪可以使用普通的手提紫外灯进行交联,在距离膜3-15cm的位置照3-15min,最佳交联条件需要根据标准品咨询过摸索;

b. 交联完成后进行检测,也可用保鲜膜包裹膜后置于室温干燥条件存放,可存放3-5天再进行检测。

(3) 封闭与孵育抗体

a. 封闭:取封闭液 (P1203)15ml,加入适当容器中(如抗体孵育盒), 再加入交联后的尼龙膜或者PVDF膜室温摇育15min

注:确保封闭液是完全溶解的状态再使用。

b. 7.5ul Streptavidin-HRP 稀释于 15ml 封闭液(按照 1:2000 稀释),将封闭后的膜加入封闭液中,置于摇床(水平或者侧摆皆可)室 温孵育15min

注:Streptavidin-HRP 稀释液可以重复使用3-4次,建议保存于-20℃1月内使用完。

c. 洗涤:将5X 洗涤液25ml用蒸馏水或者milliQ稀释至 1X (稀释后体积25ml),取稀释后的洗涤液20ml洗膜,洗膜4 次(每次 5min)。

d. 将膜转至含有20-25ml 检测平衡液的孵育盒中,在摇床上缓慢摇动 5 min

(4) ECL显色

a. ECL发光液A液和B液各5ml 1:1 混合 ECLA/B 液制成发 光工作液。

注:发光液必须现用现配。

b. 将检测平衡液中的膜取出用吸水纸吸掉过多液体,置于保鲜膜或者干净的容器内,在膜表面添加发光工作液至覆盖全部的膜,室温静置 2-3 min

c. 将膜放于2片保鲜膜或者其他适当透光薄膜中间病故定于压片暗盒内部,用X光胶片压片1-5min,显影定影,或者直接用化学发光图像分析系统中扫描成像。

 

注意事项:

1.      探针设计时要确保探针包含蛋白结合位点,长度建议 20-40bp

2.      为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。


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产品编号

产品名称

包装规格

NBS8042

EMSA/Gel-Shift化学发光法EMSA试剂盒

100T

NB8043-1ml

4xEMSA/Gel-Shift上样缓冲液(无色)

1ml

NBS8044-1ml

4xEMSA/Gel-Shift上样缓冲液(蓝色)

1ml

NBS3019-100ml

超敏ECL化学发光显色液

2×50ml

NBS3020-100ml

特超敏ECL化学发光显色液

2×50ml

NBS3121-100ml

极超敏ECL化学发光显色液

2×50ml

NBS5325-25ml

6xDNA上样缓冲液

25x1ml