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LDS 751是一种细胞膜通透性的核酸染色剂，用于从无核和受损的有核细胞中区分完整的有核细胞，以及在混合的中性粒细胞、淋巴细胞和单核细胞中用流式细胞术区分不同的细胞类型。LDS 751与dsDNA结合的最大激发波长~543nm，能用488nm氩离子激光器来激发，由于具有较长的最大发射波长 (∼712 nm) 而特别适用于多色分析。与dsDNA的结合引起~20倍的荧光增强。噻唑橙（主要结合RNA，货号：NBS7693）和LDS 751（主要结合DNA）用来区分红细胞、血小板、网织红血球和有核细胞。 -
DRAQ7是一种不具细胞通透性的远红外DNA染料，仅对死细胞和透化细胞的核染色，能与其它常见的标记染料（比如：GFP或FITC）联合使用。DRAQ7是一种理想工具用于研究死细胞或膜受损细胞，因其不用进入完整膜结构的活细胞。DRAQ7是碘化丙啶（PI）和7-AAD的理想替代品，因其不能被紫外激发，且与PE/PE同源物没有发射光重叠。 DRAQ7的关键特征包括：1）快速染色死细胞或透化细胞的dsDNA/核；2）低光漂白；3）适用于绝大多数细胞，真核和原核来源：哺乳动物、细菌、寄生虫、植物等；4）长期培养无毒性；5）能与活细胞染料结合使用；6）流式细胞检测中与常见的FITC/GFP+PE结合实验无需做荧光补偿；7）不用清洗或RNase处理； -
DRAQ5是一种细胞通透性的远红外DNA染料，能联合其它常见的标记染料比如：GFP或FITC，用于固定或非固定/活细胞的染色。与任何其它细胞通透性的DNA嵌入染料一样，DRAQ5在长期实验中可能抑制细胞分裂，需测定染料可能的任何效应。 -
Golgi-Tracker Green是神经酰胺的荧光偶联物，即BODIPY™ FL标记的C5-ceramide（BODIPY™ FL C5- Ceramide），选择性结合高尔基体（Golgi apparatus），Ex/Em=505/511nm（光谱特征见Fig 1），用荧光素光学滤片设置来观察。Golgi-Tracker Green与同类型的NBD C6-ceramide相比较，表现出更好的抗光衰减性和更明亮的荧光，在很多应用上都能替代NBD C6-ceramide。Golgi-Tracker Green也能用于鞘脂运输和代谢研究，测定Schwann细胞合成脂类的速率，以及标记细胞轮廓以便在共聚焦显微镜下观察形态运动。 -
Golgi-Tracker Red是神经酰胺的荧光偶联物，即BODIPY™ TR标记的Ceramide（BODIPY™ TR Ceramide），选择性结合高尔基体（Golgi apparatus）Ex/Em=589/617nm，用Texas Red光学滤片设置来观察。Golgi-Tracker Red与同类型的NBD C6-ceramide相比较，表现出更好的抗光衰减性和更明亮的荧光，在很多应用上都能替代NBD C6-ceramide。Golgi-Tracker Red也能用于鞘脂运输和代谢研究，测定Schwann细胞合成脂类的速率，以及标记细胞轮廓以便在共聚焦显微镜下观察形态运动。 -
NBD C6-Ceramide是一种荧光鞘脂类似物，常用来研究鞘脂运输和代谢机制。也常用作活细胞和固定细胞内高尔基体的选择性染色剂。环境敏感性的NBD染料在水溶性环境下呈弱荧光，但在非质子溶剂和其它非极性环境内荧光增加，最大激发和发射波长约为466/536nm。 -
丽春红（Ponceau S）染色液适用于 PVDF 膜、硝酸纤维素膜及醋酸纤维素膜上的蛋白检测。该染料带负电荷，能与蛋白中带正电荷的氨基酸残基及非极性区域结合，呈现清晰的红色条带。 -
阿尔玛蓝（Alamar Blue）是一种细胞活力检测试剂，包含一种具细胞膜渗透性、无毒性且弱蓝色荧光的指示剂，即刃天青（resazurin）。自从1993年开始刃天青就作为一种值得信赖和可靠的试剂被引用。阿尔玛蓝是MTT（噻唑兰）的有效且无毒替代物。阿尔玛蓝能定量检测人、哺乳动物、细菌、真菌和支原体细胞的增殖情况，也能用于细胞因子生物活性、细胞活力分析、体外细胞毒性确定以及细胞生长监测。
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MTT也称作溴化噻唑蓝四氮唑，是一种黄色染料，已经广泛替代传统的台盼蓝染色法或者放射性同位素插入法，用来检测细胞活力、细胞增殖以及毒性分析。MTT是一种可接受氢离子的化合物染料，带正电荷，具有细胞膜渗透性。活细胞线粒体中的琥珀酸脱氢酶能够将外源进入的MTT还原成为水不溶性的蓝紫色MTT-甲臜结晶，而死细胞不具此功能。甲臜结晶不能穿透细胞膜，因此沉积在处于增殖且未受损伤的细胞内。在特定溶剂的作用下完全溶解甲臜结晶，然后通过酶标仪测定570 nm附近的吸光度。细胞增殖越多，则吸光度越高；细胞毒性越大，则吸光度越低。
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台盼蓝（Trypan Blue，CAS NO. 72-57-1）是一种蓝色酸性染料，含有两个偶氮发色团。是一种较大、亲水和四磺酸化的阴离子染料，普遍用于检测细胞膜的完整性以及评估细胞的存活率。作为一种鉴定细胞存活的简易方法，台盼蓝渗透进入丧失活性或细胞膜不完整的细胞将其染成蓝色（通常认为细胞膜完整性丧失，即可认为细胞已经死亡），而具有完整细胞膜的活细胞将染料排斥在外。因此，台盼蓝染色后，通过显微镜下观察颜色的差异即可肉眼区分死细胞和活细胞，通过计数就可对细胞存活率进行比较精确的计算。
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