FastCut® EcoRI
产品编号 | 产品名称 | 包装规格 | 价格 |
NBS8162 | FastCut® EcoRI | 600 rxns | 298 |
产品简介:
FastCut®快速内切酶是一系列经过基因工程重组的快速限制性内切酶,适用于质粒 DNA、PCR 产物或基因组 DNA 等的快速酶切。所有 FastCut®快速内切酶在通用的 CutOne® 或 CutOne® Color Buffer 中都具有优良的活性,能够在 5~15 分钟内完成酶切。此外去磷酸化、连接试剂在CutOne® Buffer中均具有100% 活性,支持一管化反应,提升“酶切 - 修饰 - 连接”的体验。
CutOne® Color Buffer包括红色和黄色示踪染料,可将产物直接用于凝胶电泳。CutOne® Color Buffer 的红色染料与2500 bp 双链DNA片段在 1% 琼脂糖凝胶中迁移速率接近;黄色染料与10 bp双链DNA片段在 1% 琼脂糖凝胶中迁移速率接近。
识别位点:
GAATTC
5'...G ↓ A A T T C...3'
3'...C T T A A ↑ G...5'
同裂酶:FunII
注:同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
产品组成:
组分 | 规格 |
FastCut® EcoRI | 600 μl |
10× CutOne® Buffer | 2x1 ml |
10× CutOne® Color Buffer | 2x1 ml |
保存条件:
-20℃保存,2年有效。
建议反应条件:
1× CutOne® 缓冲液;
37℃温育;
参照“DNA 快速酶切流程”配制反应体系。
失活条件:
80℃温育20 min。
功能活性检测:
37℃下,在20 μl通用CutOne®反应体系中,1 μl FastCut® EcoRI能够在15 min内完全消化1 μg λDNA。
超长时间温育检测:
37℃下,在20 μl通用CutOne®反应体系中,将1 μl FastCut® EcoRI与1 μg λDNA共同温育3 h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解。更长时间酶切可能出现星号活性。
酶切-连接-再酶切检测:
37℃下,使用10倍酶量的FastCut® EcoRI消化DNA底物,回收酶切产物,在22℃下使用T4 DNA Ligase (Fast)可以将超过95%的酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开约95%以上的连接产物。
非特异性内切酶活性检测:
37℃下,在20 μl通用CutOne®反应体系中将1 μl FastCut® EcoRI与 1 μg超螺旋质粒DNA共同温育4 h后,使用琼脂糖凝胶电泳检测,少于10%的质粒DNA转变成缺刻或线性状态。
蓝白斑检测:
使用1 μl FastCut® EcoRI消化含有lacZα 基因且仅在该基因上具有1个酶切位点的特定载体。将酶切产物重新连接后转化到大肠杆 菌感受态细胞中,涂布在含有X-gal、IPTG和相应抗生素的LB平板培养基上生长。成功连接的β-半乳糖苷酶基因可以正确表达,并生长出蓝色菌落;而因酶切末端降解等原因未能重新连接的产物将得到白色菌落。对于FastCut®系列限制酶而言,白色菌落的比例应当小于 1%。
使用方法:
1. DNA快速酶切流程
① 在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:
质粒DNA | PCR产物 | 基因组DNA | |
ddH2O | 15μl | 16μl | 30μl |
10× CutOne® Buffer 或 10× CutOne® Color Buffer | 2μl | 3μla | 5μl |
底物DNA | 2μl (up to 1μg) | 10μl (~0.2μg) | 10μl (5μg) |
FastCut® EcoRI | 1μl | 1μl | 5μl |
Total | 20μl | 30μl | 50μl |
a.本体系适用于经过纯化的PCR产物酶切。未纯化的PCR产物具备一定的离子强度,10× CutOne® Buffer 加入量可适当减少至2 μl。但由于DNA聚合酶同时具有外切酶活性,会影响酶切产物,因此如下一步需进行克隆等操作,建议酶切前对PCR产物进行纯化。
② 轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;
③ 37℃温育15 min(质粒),或15~30 min(PCR产物),或30~60 min(基因组DNA); ④ 80℃温育20 min即可使酶失活,停止反应(可选);
⑤ 如果使用CutOne® Color Buffer进行酶切反应,得到的产物可以直接进行上样电泳。
2. 双酶切或多酶切
① 每种快速内切酶的用量为1 μl,并根据需要适当扩大反应体系;
② 所有快速内切酶的体积总和不得超过总反应体系的1/10;
③ 如果所用的几种快速内切酶的最适反应温度不同,应先以最适温度低的酶开始酶切,再添加最适温度较高的酶,在其最适反应温度下进行酶切反应。
3. 适用于质粒的扩大反应体系
DNA | 1μg | 2μg | 3μg | 4μg | 5μg |
FastCut® EcoRI | 1μl | 2μl | 3μl | 4μl | 5μl |
10× CutOne® Buffer 或10×CutOne® Color Buffer | 2μl | 2μl | 3μl | 4μl | 5μl |
Total | 20μl | 20 μl | 30μl | 40 μl | 50 μl |
注:如果总反应体系大于20 μl,应适当增加温育时间,尽量使用水浴、金属浴或沙浴。
不同DNA中的酶切位点数量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
5 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 |
甲基化修饰影响
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
无影响 | 无影响 | 剪切受影响 | 无影响 | 剪切受影响 |
在不同反应缓冲液中的活性
CutOne® Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB rCutSmart™ Buffer | Takara QuickCut™ Buffer | ||
活性 | 100% | 100% | 100% | 100% | |
注:活性数据来自限制酶标准反应体系下的检测。
注意事项:
1. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。