<NBS8162> FastCut® EcoRI

栏目:NoninBio
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识别位点:
GAATTC
5'...G ↓ A A T T C...3'
3'...C T T A A ↑ G...5'

同裂酶:FunII
注:同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。

 

FastCut® EcoRI

 

产品编号

产品名称

包装规格

价格

NBS8162

FastCut® EcoRI

600 rxns

298

 

产品简介:

FastCut®快速内切酶是一系列经过基因工程重组的快速限制性内切酶,适用于质粒 DNAPCR 产物或基因组 DNA 等的快速酶切。所有 FastCut®快速内切酶在通用的 CutOne®  CutOne® Color Buffer 中都具有优良的活性,能够在 5~15 分钟内完成酶切。此外去磷酸化、连接试剂在CutOne® Buffer中均具有100% 活性,支持一管化反应,提升酶切 - 修饰 - 连接的体验。

CutOne® Color Buffer包括红色和黄色示踪染料,可将产物直接用于凝胶电泳。CutOne® Color Buffer 的红色染料与2500 bp 双链DNA片段在 1% 琼脂糖凝胶中迁移速率接近;黄色染料与10 bp双链DNA片段在 1% 琼脂糖凝胶中迁移速率接近。

 

识别位点:

GAATTC
5'...G ↓ A A T T C...3'
3'...C T T A A ↑ G...5'

同裂酶:FunII

注:同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。

 

产品组成:

组分

规格

FastCut® EcoRI

600 μl

10× CutOne® Buffer

2x1 ml

10× CutOne® Color Buffer

2x1 ml


保存条件

-20℃保存,2年有效。


建议反应条件:

1× CutOne® 缓冲液;

37℃温育;

参照“DNA 快速酶切流程配制反应体系。

 

失活条件:

80℃温育20 min

 

功能活性检测:

37℃下,在20 μl通用CutOne®反应体系中,1 μl FastCut® EcoRI能够在15 min内完全消化1 μg λDNA

 

超长时间温育检测:

37℃下,在20 μl通用CutOne®反应体系中,将1 μl FastCut® EcoRI1 μg λDNA共同温育3 h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解。更长时间酶切可能出现星号活性。

 

酶切-连接-再酶切检测:

37℃下,使用10倍酶量的FastCut® EcoRI消化DNA底物,回收酶切产物,在22℃下使用T4 DNA Ligase (Fast)可以将超过95%的酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开约95%以上的连接产物。

 

非特异性内切酶活性检测:

37℃下,在20 μl通用CutOne®反应体系中将1 μl FastCut® EcoRI 1 μg超螺旋质粒DNA共同温育4 h后,使用琼脂糖凝胶电泳检测,少于10%的质粒DNA转变成缺刻或线性状态。

 

蓝白斑检测:

使用1 μl FastCut® EcoRI消化含有lacZα 基因且仅在该基因上具有1个酶切位点的特定载体。将酶切产物重新连接后转化到大肠杆 菌感受态细胞中,涂布在含有X-galIPTG和相应抗生素的LB平板培养基上生长。成功连接的β-半乳糖苷酶基因可以正确表达,并生长出蓝色菌落;而因酶切末端降解等原因未能重新连接的产物将得到白色菌落。对于FastCut®系列限制酶而言,白色菌落的比例应当小于 1%

 

使用方法:

1. DNA快速酶切流程

在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:


质粒DNA

PCR产物

基因组DNA

ddH2O

15μl

16μl

30μl

10× CutOne® Buffer 10× CutOne® Color Buffer

2μl

3μla

5μl

底物DNA

2μl (up to 1μg)

10μl (~0.2μg)

10μl (5μg)

FastCut® EcoRI

1μl

1μl

5μl

Total

20μl

30μl

50μl

a.本体系适用于经过纯化的PCR产物酶切。未纯化的PCR产物具备一定的离子强度,10× CutOne® Buffer 加入量可适当减少至2 μl。但由于DNA聚合酶同时具有外切酶活性,会影响酶切产物,因此如下一步需进行克隆等操作,建议酶切前对PCR产物进行纯化。

轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;

③ 37℃温育15 min(质粒),或15~30 minPCR产物),或30~60 min(基因组DNA); ④ 80℃温育20 min即可使酶失活,停止反应(可选);

如果使用CutOne® Color Buffer进行酶切反应,得到的产物可以直接进行上样电泳。

 

2. 双酶切或多酶切

每种快速内切酶的用量为1 μl,并根据需要适当扩大反应体系;

所有快速内切酶的体积总和不得超过总反应体系的1/10

如果所用的几种快速内切酶的最适反应温度不同,应先以最适温度低的酶开始酶切,再添加最适温度较高的酶,在其最适反应温度下进行酶切反应。

 

3. 适用于质粒的扩大反应体系

DNA

1μg

2μg

3μg

4μg

5μg

FastCut® EcoRI

1μl

2μl

3μl

4μl

5μl

10× CutOne® Buffer

10×CutOne® Color Buffer

2μl

2μl

3μl

4μl

5μl

Total

20μl

20 μl

30μl

40 μl

50 μl

注:如果总反应体系大于20 μl,应适当增加温育时间,尽量使用水浴、金属浴或沙浴。

 

不同DNA中的酶切位点数量

λDNA

ΦX174

pBR322

pUC57

pUC18/19

SV40

M13mp18/19

Adeno2

5

0

1

1

1

1

1

5

 

甲基化修饰影响

Dam

Dcm

CpG

EcoKI

EcoBI

无影响

无影响

剪切受影响

无影响

剪切受影响

 

在不同反应缓冲液中的活性


CutOne® Buffer

Thermo Scientific

FastDigest Buffer

NEB

rCutSmart™ Buffer

Takara

QuickCut™ Buffer

活性

100%

100%

100%

100%







注:活性数据来自限制酶标准反应体系下的检测。

 

注意事项:

1.      为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。